厉害了，液体活检！cfDNA伴随诊断成功案例量化

引子

已经有，Grail作准备注资10亿美元计划招募7000初诊前列腺癌和3000 健康成年人，致力于血检一时期药理学标记物的技术开发[1]。尿液定期检查要时值了吗？从技术；也和可用者的角度吐槽一下气泡现在列腺的十分十分困难和现在景。抛砖引玉。节录气泡现在列腺与传统一个组织现在列腺的优劣势相当现在当年参加气泡现在列腺联席会议的时候，还心里它离确实应用领域还远，FDA的指南也含糊其词。一年多基本上，已经有多款气泡现在列腺特别是在药理学系列产品获FDA核准，或已经受益众多药理学统计数据，作准备审报了。气泡(抗体) 现在列腺的拓展居然可以用日新月异来形容。气泡现在列腺主要包括尿液里面的循环巨噬细胞（circulating tumor cells，CTCs)， cell-free DNAs (cfDNA)， 外泌体（exosome）等。CTCs 火了几年，在2013年出发颇高峰后发现应用领域有许多单单，被迅速崛起的cfDNA变为。外泌体发现还相当新，虽然拓展迅速，但离应用领域还有距离。这里主要讨论cfDNA的十分十分困难，主要是特别是在药理学和用药可视多方面的应用领域。血检与一个组织定期检查相相当竞争者在于：不方便，并能，第一时间，便宜，微创。越来越关键性的是，血检只能保住许多一个组织探头难以获取 (when tissue is an issue)，或一个组织探头量、质量不颇高的病患获取凋亡制剂，或参与药理学研究的机会。比如，完成超过30，000药理学检验的Guardant Health美联社，血检步骤保住了颇多达50.2%的药理学病患的凋亡凋亡突变的信息，这些病患要么一个组织探头难以获取，要么探头质量不颇高，无法定期检查到有毒凋亡。不是所有巨噬细胞则会将凋亡的碎片DNA释放到尿液里面，有所不同一般而言的的血检检出亲率也不一致。据Guardant Health的美联社，心肌梗塞检出亲率最颇高，平均为92%，非小巨噬细胞心肌梗塞89%，最更高的胶质母巨噬细胞瘤检出亲率只有57%。这是血检的最大的限制性硬伤之一。也是一个组织现在列腺永远都倍数得注意的依据所在 (仍旧是金新标准)。抗体cfDNA定期检查还有许多其它原创性因素，比如：· DNA片段小，50-200 bp（峰倍数165 bp）。· 半衰期短，30 分钟，之后稳定。· 更高含量/丰度：更高nM/mL 抗体。· 随着治果的上升，DNA比亲率急遽减少。· 正常巨噬细胞DNA的污染。血检在非小巨噬细胞心肌梗塞的应用领域随着技术的不断进步，血检已经取得非常大的急于。血检十分十分困难最快和最茁壮的也是具有最迫切期望的是心肌梗塞凋亡制剂的特别是在药理学。心肌梗塞病者多，死亡亲率颇高，凋亡用药技术开发十分十分困难快。同时心肌梗塞一个组织采样十分困难，小心，难以抑制并发症。心肌梗塞药理学护士和病患对血检的期望是最不遗余力的。心肌梗塞血检十分十分困难最快的是EGFR引人注目凋亡的定期检查。EGFR凋亡在欧美各国成年人%非小巨噬细胞心肌梗塞的15%以上，是个相当多的病患成年人。在全国性比亲率颇多达25%以上。FDA去年已经核准了Roche的cobas血检试剂盒运用于一线EGFR凋亡的酪氨酸嘌呤小分子特别是在药理学 (2016-6-1)，以及二线三代AZD9291（TAGRISSO）的特别是在药理学 (2016-9-28)。根据已经发表的EGFR T790M阳性病患的统计数据，一个组织现在列腺受益的药理学试验统计数据总体应答亲率（ORR）为62%，无十分十分困难生存期（PFS）为9.7个月，血检的ORR为63%，PFS为9.7月。二者统计数据非常相符[2]。血检与一个组织现在列腺精确性也很颇高。许多其它的一些公司系列产品里面都值得注意EGFR的凋亡定期检查。其余部分具体表现血检试剂盒汇总阿斯利康 (AZD) 总成本了大量的精力来定期检查三代AZD9291的获取性致病凋亡系统，最新的调查报告统计数据揭示平均有20%的致病凋亡由C797S凋亡合组 (100 例病患统计数据)，即凋亡了AZD9291的二聚体结合位点。这个比亲率比以现在的美联社要更高[3]。期待后续的一个组织现在列腺统计数据美联社，可以相当二者的精确性。其它的凋亡多为零散分布。同时，AZD也在定期检查内在 (原发) 凋亡系统，越来越多的统计数据在月份的AACR上确实有越来越新。至于用NGS多第一组(panel) 定期检查，Guardant Health 在发行Guardant 360后，又全面发行Guardian 500+， 与多个大型制剂一些公司合作，运用于药理学定期检查，比对潜在的相关凋亡突变。这与NCI即将进行的伞式（umbrella）和篮式（basket）药理学试验的前提是相符的。即大规模比对病患成年人的可凋亡凋亡，推进，加速凋亡用药的可用和技术开发某种程度。当然，第一组也不是越大越好，如果入选的凋亡突变不是动力有毒凋亡，或者不可凋亡，不能对病患缺少药理学内涵，内涵或许不大，徒增成本。NGS panel与PCR步骤相相当，值得一提的是了未来越来越先进的技术。当现在，可用者用有所不同一些公司的系列产品得出的结果差异性还很大[4]。AZD的转化部门的VP Carl Barrett 甚至给出了几种主流系列产品20%相符亲率的倍数，令人震惊大掉下巴。Barrett提及，即将用具体表现的抗体和一个组织探头来相当有所不同一些公司的系列产品的可靠性，结果可能会在月份AACR年会上公布。或许，相相当PCR的步骤，NGS在血检上还需要全面此后提颇高引人注目性和精确性。从辉瑞公布的ALK 融合凋亡3代ALK类似物Lorlatinib的抗体cfDNA ALK凋亡药理学统计数据，我们只能受益哪些有用的信息呢？他们用的是BEAMing dPCR 的步骤[5]。值得注意深感作者对步骤的可用性非常不满，因为ALK的致病凋亡一般而言较多，得随着药理学十分十分困难不断调整PCR引物和反应条件。从38例病患的抗体cfDNA里面，定期检查到有14例病患有ALK致病凋亡。这个比亲率与以现在美联社的一个组织定期检查统计数据十分。同时，ALK的凋亡一般而言，比亲率分布模式也与以现在的美联社类似。抗体现在列腺与以现在的一个组织现在列腺相相当，只能定期检查到越来越丰富的信号。凋亡的互补其后受益验证。以现在一个组织定期检查的结果，比方说致病凋亡为ALK单一凋亡，只有个别是双凋亡。但抗体定期检查到的结果则揭示，有一半的病患的ALK致病凋亡等于或多于2个凋亡，最多的有4个凋亡。Lorlatinib的ALK活性急遽提颇高，比一代ALK类似物Crizotinib的活性提颇高了20-50倍，药理学现在统计数据表明，它只能弥补差不多所有的ALK致病凋亡，特别对门控凋亡L1196M有极颇高的活性。但耐人寻味地是，在所有值得注意L1196M的六例凋亡病患里面，有三例总称有效亲率反应，另外三例真实感不佳。根据以现在的美联社，真实感不佳的病患，有很大的某种程度是由于Src活性上升造成的内在抗药系统变换引起的[6]。Src嘌呤活性上升难以用突变定期检查的步骤观察到，不用借助酶组学的信息。这也从下方解读出突变定期检查不是万能的，还要与其它有效亲率的步骤借鉴，互补。Lorlatinib的ALK致病凋亡有一例美联社，即L1198F[7]。（抗体现在列腺的结果里面还无法发现比方说的凋亡）这个新的致病凋亡不能被二代ALK类似物弥补，却对一代ALK类似物Crizotinib十分引人注目，从而形成一个良性循环 (loop) 用药必需，把恶性除去可控制的慢性病。这确实是在发现最终治愈手段之现在我们对凋亡制剂期望里面理想的“小前提”了。血检在结直心肌梗塞、肝胃癌上的应用领域除了心肌梗塞，末期结核结直心肌梗塞（mCRC）是血检拓展较快的。即KRAS凋亡的定期检查。它不是运用于KRAS本身的凋亡（还无法有效亲率的从外部凋亡用药，用药化学家打气！），而是用来导师EGFR免疫用药 (如cetuximab)，即有RAS野生型的病患对EGFR免疫有效亲率，KRAS凋亡的病患真实感不显着。德国的Merck在这个正向最不遗余力。与Sysmex合作技术开发OncoBEAM定期检查科学仪器运用于KRAS药理学特别是在定期检查，与一个组织现在列腺的精确性达到>92%[8]。与Biocartis合作技术开发傻瓜型药理学一体化科学仪器（研究用）。只要把1mL抗体加入到定期检查科学仪器里面，130 分钟后自动出结果。自诩10岁的小孩就可以操作。除了特别是在药理学，KRAS血检还可以运用于用药治果，导师用药，停药决定。如有美联社的病例，EGFR免疫可用造成野生型的RAS发生凋亡，癌症十分十分困难后建议停止可用EGFR免疫，并可用其它病患步骤，等KRAS凋亡定期检查呈阴性后，可以此后可用EGFR免疫。这些不方便，灵敏，对病患友好的RAS凋亡静止状态的动态受控，正是血检的竞争者所在，受到护士病患的不遗余力响应。虽然KRAS凋亡在非小巨噬细胞心肌梗塞里面%的比亲率颇多达25%以上，但由于无法有效亲率的从外部凋亡KRAS的用药可以可用，所以KRAS凋亡信息在心肌梗塞病患里面对病患的导师内涵当现在还很极少，好在免疫制剂对KRAS凋亡应答亲率还不错。已经有在EORTC-NCI-AACR联席会议上美联社的肝胃癌（GISTs）的一期药理学过程里面，完美地应用领域了气泡现在列腺的手段，cKIT和PDGFR的致病凋亡动态变化。Imatinib（Gleevec）在CML具有但会神药的名号，但在在肝胃的凋亡凋亡上，却很快就产生了致病凋亡。BLU-285和DCC-2618就是外观设计出来的二代，用来弥补一代的致病凋亡。基本上血样气泡现在列腺只能及时，确切的药理学用药的可用真实感[9]。或许，以后凋亡致病药理学试验的气泡现在列腺有逐渐要成为新标准定期检查之一的保守。血检cfDNA的其它应用领域现在景随着cfDNA技术的不断进步和茁壮，用基本上尿液cfDNA探头来大规模SNP罕唯动力有毒凋亡获取了很好的机会，比如TRKA， B， C 融合凋亡在差不多大比方说子类里面都有隐含，但比亲率都不颇高[10]。这样，即使有很好的TRK小分子类似物，因为病者招募非常十分困难，新药技术开发十分十分困难缓慢。如果基本上血检panel只能受益推广，新药药理学技术开发可以大大提速。其它的例子象在非小巨噬细胞心肌梗塞，c-RET的融合凋亡有1-2%，c-MET 外显子14聚合凋亡在心肌梗塞有2-4%等，都是动力有毒凋亡，却因为病者量相对于较少，严重阻碍了小分子用药药理学技术开发十分十分困难与获批[11]。肺癌里面的PIK3CA 凋亡，黑素瘤里面的BRAF（V600E）也是气泡血检的研究热点。用抗体cfDNA的手段来定期检查突变的过量隐含还非常十分困难。很多时候，cfDNA的隐含量与一个组织相应酶隐含含量不成正比。像肺癌的HER2定期检查可能还要越来越多的依赖于传统一个组织定期检查手段。至于许多其他的子类，特别是有毒凋亡突变不明确，凋亡用药缺乏的情况下，血检的关键性性和迫切性还不是很值得注意。随着免疫制剂药理学统计数据的不断积累，大规模的NGS血检统计数据或许可以除此以外预判免疫反应的不确定性，用来导师潜在的用药第一组。这确实是较为遥远的前提。最后，最具社会价倍数的应用领域之一是前列腺癌特别是心肌梗塞的一时期药理学了。心肌梗塞总体5年死亡亲率只有18%。如果只能一时期发现，一期的五年死亡亲率颇多达45-49%，二期也有30%。三期14%，四期只有1% (美国前列腺癌协会com统计，2000年的少有的一时期统计数据，过去心肌梗塞末期死亡亲率确实提颇高了很多，唯[11])。由于心肌梗塞总称看不唯，摸不着的子类，同时一时期发病时症状也不值得注意，引发比方说病患确诊时已是末期。气泡血检一时期药理学还处在起步前期，也是Grail要奋斗的正向。当然，泼冷水的也大有人在，批评他们好颇高骛远，根本就是颇高大上全， 不如来点毕竟的[1]。我心里这是一个有现在景的正向，特别倍数得募捐基金注资。